Diskpart es una utilidad que se ejecuta a través de la linea de comandos y sirve para administrar discos, particiones, volumenes….
Existen otras aplicaciones de terceros mejores, pero ya tienes que descargar e incluso algunas instalar, con Diskpart puedes hacer la mayoría de operaciones que necesitas.
En Diskpart existe un comando que suelo utilizar muy a menudo para limpiar y eliminar todas las particiones creadas en los USB Booteables, por ejemplo cuando crear un usb de arranque para VMware ESXi, puedes eliminar la mayoría de las particiones a mano, pero siempre hay alguna que no te deja, como en la siguiente imagen.
Para iniciar Diskpart, escribimos Diskpart en el prompt, donde se abrirá otra ventana.
Para ver el disco del que queremos quitar la configuración escribimos list disk para listar los discos conectados, en este caso es el disco 3.
Una vez detectado el disco lo seleccionamos con select disk 3
En la ayuda podemos ver todos los comando disponibles
Escribimos clean, que con este comando eliminas toda la información y particiones del disco.
Y en un momento te deja el disco mas limpio que la patena y sin inicializar.
Una vez finalizado todo el dispositivo estará disponible para inicializar y dale formato.
Saludos y espero que os sirva.